O Aeroporto funciona e opera com aeronaves da aviação geral não regular de pequeno porte. Atualmente, estão instaladas 10 empresas de táxi aéreo, três  empresas de manutenção de aeronaves e 01 aeroclube.
A aeronave de maior capacidade para transporte de passageiros que opera atualmente no SBJC possui sete assentos, entretanto a aeronave crítica é o E-110 (Bandeirante).

As operações aéreas, que abrangem destinos como Ilha do Marajó, o sul e nordeste do Pará e municípios de Estados vizinhos, se caracterizam por transportar turistas, autoridades e principalmente, valores e enfermos.

No que se refere ao movimento operacional observa-se um crescimento de 17,28% em relação ao mesmo período em 2009.