Em 1981, quando a Infraero assumiu a administração do Aeroporto de Ilhéus, este operava com apenas quatro voos regulares e um número pequeno de aviões de segundo nível. Nesta época, o aeroporto contava com seis voos diários de porte médio, além dos voos charters nos finais de semana.

O tráfego de passageiros aumentou cerca de 80% desde aquela época. Nos finais de ano, o aeroporto registra um incremento muito grande de voos charters originados principalmente de São Paulo, Brasília, Belo Horizonte e Rio de Janeiro. O Aeroporto de Ilhéus/Bahia — Jorge Amado opera com oito voos diários, sem contar com os voos da aviação geral. É a principal porta de entrada de turistas que visitam as praias do sul da Bahia.